Dans le cas des ordinateurs de bureau, il existe beaucoup de formats de carte mère. Les plus répandus sont les formats ATX et Micro-ATX. Ils permettent une optimisation de la circulation de l'air dans la tour du PC ainsi qu'un accès facilité aux composants pour installer sans difficulté les câbles et connectiques de chacun. La différence entre ces deux formats est leur dimension : le format Micro-ATX dispose en général de deux fois moins de connecteurs PCI que le format ATX, soit entre 2 ou 3 emplacements PCI. Ce qui reste plus que suffisant lorsque l'on n'a pas besoin de rajouter de cartes additionnelles. La question devient plus complexe dans le cas des ordinateurs portables. Il n'existe pas de standard dans ce milieu, puisque la gestion de l'espace au sein du châssis fait partie des enjeux importants du marché.
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Ainsi, chaque constructeur aura son propre format de carte mère qu'il pourra changer (pour créer un PC plus léger ou à l'inverse plus complet avec de nombreuses connectiques).
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